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Role of rs16944 (IL1B) and rs5743899 (TOLLIP) polymorphisms in the year-long presence of rhinovirus in the nostrils of healthy young volunteers
| datacite.subject.fos | Ciências Médicas::Medicina Básica | pt_PT |
| dc.contributor.advisor | Cabeda, José Manuel | |
| dc.contributor.author | Marino, Roberta | |
| dc.date.accessioned | 2018-12-07T08:10:15Z | |
| dc.date.available | 2018-12-07T08:10:15Z | |
| dc.date.issued | 2018-06-20 | |
| dc.description.abstract | A infecção por rinovírus é uma das causas mais frequentes da constipação. Os mais afetados são crianças, idosos e portadores de doença respiratória crónica, que podem incorrer em doenças mais graves e complicações. Os rinovírus pertencem à família Picornaviridae sendo assim pequenos vírus de RNA de cadeia positiva com uma cápside proteica icosaédrica. Estes vírus são transmitidos muito facilmente atacando principalmente a mucosa nasal, mas a frequência e intensidade da infeção varia muito com os indivíduos e a época do ano. No presente trabalho procuramos caracterizar a influência de 2 polimorfismos em genes do sistema imunológico inato na infeção pelo rinovírus. Para tal, 89 voluntários (estudantes universitários) doaram mensalmente amostras nasais para a deteção rinovírus por RT-qPCR. Alguns destes indivíduos doaram também uma amostra de sangue (n=33) ou de epitélio bucal (n=15) para obter DNA genómico e caracterizar SNP’s dos genes TOLLIP e IL1B (rs5743899 e rs16944 respetivamente) por PCR-RFLP. Os resultados não revelaram qualquer associação do polimorfismo rs16944 (IL1B) e a presença de rinovírus nasal. Contudo todos os indivíduos que nunca testaram positivo para o rinovírus apresentaram o alelo G do polimorfismo rs5743899 (gene TOLLIP), sugerido um possível efeito deste alelo na eficaz eliminação imediata do rinovírus antes de ocorrer infeção viral. Contudo, o mesmo alelo apresentava também os valores mais elevados de títulos nasais de rinovírus, sugerindo que uma vez estabelecida a infeção estes indivíduos têm maior dificuldade em a controlar. Estes resultados estão em linha com estudos anteriores indicando que este alelo diminui a expressão de TOLLIP, potenciando a sinalização via TLR2, uma via particularmente importante no reconhecimento da cápside viral. Outros estudos revelaram ainda que o mesmo alelo está associado à diminuição da expressão de genes antivirais importantes como o IFN-λ1, o que pode potenciar uma menor eficácia de eliminação viral assim que a infeção viral ocorre. | pt_PT |
| dc.description.abstract | Rhinovirus infection is one of the most frequent causes of the common cold. Individuals most affected are children, elders and chronic respiratory patients who may present complications and a more severe, even life-threatening disease. Rhinoviruses belong to the Picornaviridae family thus being positive stranded RNA viruses with an icosahedral proteic capsid. These viruses are easily transmitted attacking mainly the nasal mucosa, but infection frequency varies considerably among individuals and with the season. In the present work we characterized the influence of two polymorphisms in innate immune system genes on rhinovirus infection. For that purpose, 89 voluntaries (university students) donated monthly nasal swabs for rhinovirus detection by RT-qPCR. Additionally, some individuals donated a blood sample (n=33) or buccal swab (n=15) for DNA extraction and SNP characterization of rs5743899 (TOLLIP gene) and rs16944 (IL1B gene) by PCR-RFLP. Results revealed no relation between rs16944 (IL1B) and rhinovirus nasal detection. However, every single individual that did never had rhinovirus detected in their nostril throughout the one year observation period showed the rs574388 G allele (TOLLIP gene), suggesting a possible effect of this allele in the efficacious prompt elimination of the virus before infection is attained. However, the same allele showed the highest viral titres, suggesting that once the infection is established, these individuals struggle to control it. These results are in agreement with previous studies indicating that the G allele decreases TOLLIP expression increasing TLR2 signalling, a particularly important route for RHV capsid detection. Other results also indicate that the same allele decreases antiviral gene expression (particularly IFN-λ1) which may potentiate a lower efficacy of viral clearance after infection is established. | pt_PT |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10284/7101 | |
| dc.language.iso | eng | pt_PT |
| dc.subject | Rhinovirus | pt_PT |
| dc.subject | Picornaviridae | pt_PT |
| dc.subject | SNP | pt_PT |
| dc.subject | TOLLIP | pt_PT |
| dc.subject | IL1B | pt_PT |
| dc.subject | rs5743899 | pt_PT |
| dc.subject | rs16944 | pt_PT |
| dc.subject | qPCR | pt_PT |
| dc.subject | PCR-RFLP | pt_PT |
| dc.title | Role of rs16944 (IL1B) and rs5743899 (TOLLIP) polymorphisms in the year-long presence of rhinovirus in the nostrils of healthy young volunteers | pt_PT |
| dc.type | master thesis | |
| dspace.entity.type | Publication | |
| rcaap.rights | openAccess | pt_PT |
| rcaap.type | masterThesis | pt_PT |
| thesis.degree.name | Mestrado Integrado em Ciências Farmacêuticas | pt_PT |
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