Percorrer por autor "Humblot, Etienne"
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- Análise bioinformática de variações genéticas no gene MMP20 e a sua associação com amelogénese imperfeitaPublication . Humblot, Etienne; Fernandes, Ruben; Moreira, Irina de SousaA amelogénese imperfeita é uma patologia hereditária que afeta a formação do esmalte dentário, na qual mutações no gene MMP20 foram identificadas como uma das principais causas. Esta dissertação investiga o impacto de oito variantes patogénicas de MMP20 sobre a estrutura, a dinâmica e o potencial funcional da proteína, utilizando abordagens de modelagem molecular, dinâmica molecular (MD) e docking in silico. Após a modelagem tridimensional das formas selvagem e mutadas da proteína, foram realizadas simulações de dinâmica molecular de 100 ns (com 3 réplicas por sistema). As análises estruturais (RMSD, RMSF, SASA, pontes de hidrogénio) permitiram identificar perturbações variadas conforme a mutação, afetando a estabilidade global, a flexibilidade local e a geometria do sítio catalítico. Uma fase de docking molecular, envolvendo nove ligantes inibidores de MMPs, foi então conduzida para explorar a acessibilidade funcional das formas mutadas. A análise visual dos complexos revelou que algumas mutações, como E209Q, Q376X e S237Y, permitem a manutenção de uma ligação cataliticamente relevante, apesar das alterações estruturais. Outras, como H226Q e H204R, provocam uma desorganização do centro catalítico, comprometendo as interações com os inibidores. Este trabalho destaca o potencial de resiliência ou de fragilidade local do sítio ativo, dependendo da natureza da mutação, e sublinha a importância de abordagens estruturais in silico para a estratificação de variantes patogénicas. Os resultados obtidos abrem perspetivas para o reposicionamento de ligantes ou para uma personalização terapêutica nas formas genéticas de amelogénese imperfeita associadas ao gene MMP20.
